Голубые ара исчезли из обитания в природе из-за вырубки лесов, являющихся местом их обитания – галерейных лесов. Кроме того, ара селятся в дуплах в верхних ярусах леса, и также причиной их исчезновения послужило распространение в месте их обитания африканских пчел-убийц, которые селятся в дуплах, занимаемых голубыми ара.
Также одной из причин исчезновения голубых ара является массовая вырубка деревьев табебуйя – плодами этих деревьев кормятся ара. От браконьеров голубые ара тоже пострадали: эти птицы селятся годами в одном и том же гнезде, отчего браконьерам их легко выследить и поймать.
На данный момент голубые ара живут лишь в неволе, в частных коллекциях, и во всем мире их насчитывается чуть больше ста. Сейчас делают попытки вернуть этих птиц в дикую природу в питомниках и заповедниках.