Пол у черепахи болотной легче определять, когда это уже взрослая половозрелая особь.
У самцов болотных черепах более длинный хвост, а нижний щиток панциря вогнут (якобы именно для того, чтоб при спаривании самцу было легче залазить на самку). В юном возрасте у всех черепашек длинные хвосты, у самцов они остаются более длинными, когда черепашки подрастают.
Также клоака под хвостом у самок расположена ближе к панцирю, а у самца дальше.
У самцов более длинные, чем у самок, когти на передних лапах. А у самок более округлый панцирь.
На нижнем щитке панциря (пластроне) возле хвоста у самцов есть как бы V-образный вырез, а у самок он более закруглен.
Определять пол стоит у черепах, панцирь которых уже достигает в длину 10 см, что свидетельствует о том, что черепаха взрослая. Лучше всего определять пол, когда для сравнения рядом находятся несколько черепах.