Прыткая ящерица впадает в спячку осенью (в зависимости от климата зоны, в которой она проживает), когда температура воздуха становится +4-5о, то есть это еще не зимние морозы, а скорее осеннее похолодание. Обычно начало спячки попадает на сентябрь-октябрь. В средней полосе прыткие ящерицы могут отправляться на зимовку рано, задержаться же могут в условиях особенно теплой осени. На самом деле начало спячки каждый год зависит скорее индивидуально от погоды и возраста ящерицы.
Ящерицы впадают в зимнюю спячку прямо в своих норах, в которых жили летом, закрыв вход опавшими листьями и землей. Если зима будет очень холодной, а ящерица улеглась спать в недостаточно защищенном месте, она может и не выйти из зимней спячки, замерзнув.