Рыба моллинезия выглядит в зависимости от подвида, к которому она относится. Однако практически у любой разновидности моллинезии на кончиках хвоста, сверху и снизу на хвостовом плавнике есть длинные «стрелки» - как бы «усы» (лирообразный хвост), однако также у них бывает закругленный хвост, «веером». Помимо того само тело моллинезии среднего размера (самки достигают 10 см, самки всегда крупнее самцов), с выпирающим брюшком, длинное и сплюснутое по бокам. Рот у них загнут кверху.
Черные моллинезии имеют, соответственно, черную окраску. Обычные моллинезии, как правило, желто-серые или серебристые, усыпанные пятнышками разных цветов – серо-голубыми, сине-черными или желто-зелеными.
Существуют разновидности моллинезии с большим парусообразным верхним плавником – это моллинезия велифера (парусная) и моллинезия латипина. Также своеобразно выглядят моллинезии баллон, у которых укороченное тело и выпученное брюшко.